一、微生物
在生活中肝囊肿主要发病是病原微生物感染，尤其是当人们接触阿米巴原虫时，就很容易出现肝囊肿。阿米巴原虫生命力非常顽强，一般是附着于动物身上的寄生虫，有时也会出现在鱼类身上，通过这种途径受到疾病感染的病人最多，相对来说也难以治疗。病原微生物所引起的症状要注意杀虫治疗，会起到一定效果。
二、细菌感染
在生活中细菌感染也会引起肝囊肿的，菌感染一般都会造成肝脏细胞壁浸润，有的还会出现肝细胞坏死液化的情况，这样就会流出脓液，很容易造成肝细胞囊肿。细菌性肝囊肿相对来说比较容易治疗，尤其是疾病发现的早，能在短时间内将疾病治好。病人平时注意体检，肝脏疼痛的时候立刻检查，细菌性肝囊肿就不会发展到中后期。
三、肝脏出现外伤
肝脏出现外伤以后，对外部的抵抗能力就变差，而且自身容易出现肝内血肿的问题，不注意将淤血排出的话，就有可能出现肝囊肿。不过这种病因造成的肝囊肿比较少见，因为人体肝脏对血液的吸收能力相对较强，只有出现严重肝损伤、出血量较大导致肝脏无法吸收的时候，才有造成肝囊肿的可能性。肝脏出现内伤，尤其是受到剧烈撞击的时候，也可能出现肝囊肿。
