6月16日零时至24时，31个省(自治区、直辖市)和新疆生产建设兵团报告新增确诊病例19例，其中输入性病例15例(福建3例，广东3例，云南3例，上海2例，北京1例，江苏1例，湖北1例，四川1例)，地方性病例4例(均在广东)。没有新的死亡；没有新的疑似病例。
当日新增治愈出院病例15例，解除医学观察密切接触者974人，重症病例较前一日增加2例。
确诊病例337例(其中重症4例)，疑似病例1例从境外输入。共确诊6329例，治愈5992例，无死亡病例。
截至6月16日24时，据31个省(自治区、直辖市)和新疆生产建设兵团报告，确诊病例491例(其中重症病例16例)，治愈出院病例86384例，死亡病例4636例，确诊病例91511例，疑似病例1例。共追踪密切接触者1045269人，仍在医学观察的密切接触者16116人。
31个省(自治区、直辖市)和新疆生产建设兵团报告新增无症状感染者24人(全部从国外输入)；当天确诊4例(均为境外输入)；同日，14例解除医学观察(均为国外输入)；有427名无症状感染者接受医学观察(405名从国外输入)。
香港、澳门和台湾共报告了25，342例确诊病例。其中，香港特别行政区11881例(出院11601例，死亡210例)，澳门特别行政区52例(出院51例)，台湾省13409例(出院1133例，死亡478例)。
