6月29日零时至24时，31个省(自治区、直辖市)和新疆生产建设兵团报告9例新确诊病例，均为境外输入(福建2例，湖北2例，云南2例，湖南1例，广东1例，四川1例)；没有新的死亡；没有新的疑似病例。
当日新增治愈出院病例13例，解除医学观察的密切接触者1863人，重症病例1例较前一日减少。
境外输入确诊病例393例(含重症10例)，无疑似病例。共确诊6588例，治愈出院6195例，无死亡病例。
截至6月29日24时，据31个省(自治区、直辖市)和新疆生产建设兵团报告，确诊455例(其中重症11例)，治愈出院86689例，死亡4636例，报告确诊91780例，无疑似病例存在。共追踪1059505名密切接触者，15044名密切接触者仍在医学观察中。
31个省(自治区、直辖市)和新疆生产建设兵团报告新增无症状感染者9人(全部从国外输入)；当天确诊1例(从国外输入)；同日，21例解除医学观察(17例从国外输入)；医学观察无症状感染者481人(从国外输入469人)。
香港、澳门和台湾共报告了26，723例确诊病例。其中，香港特别行政区11921例(出院11628例，死亡211例)，澳门特别行政区54例(出院51例)，台湾省14748例(出院10086例，死亡643例)。
